生物信息方向博士招生-生殖医学全国重点实验室卞舒惠课题组

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南京医科大学生殖医学与子代健康全国重点实验室，前身为生殖医学国家重点实验室，立足于人类生殖健康，长期开展基础、临床和预防三位一体的生殖医学基础创新和转化应用研究，从分子、细胞和人群水平深入探讨配子发生的调控机制及其与人类生殖相关疾病的密切关系。实验室现有面积14000平方米，1500平方米的标本资源库和9900平方米的临床生殖诊疗中心。依托SKLRM管理的医药实验动物基地2万平方米，拥有符合国家标准的SPF级屏障大小鼠饲养环境、以及动物影像学、行为学等一系列先进的实验动物分析仪器设备。依托以上条件，SKLRM建立了完善的细胞生物学平台（包括SIM）、高通量测序平台、高通量蛋白质组平台、高性能计算平台、模式动物基因敲除平台、辅助生殖技术平台、出生队列资源库等，为开展高水平的研究工作提供了强有力的支撑。 kEXcEF_9P  
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卞舒惠博士，现任南京医科大学生殖医学与子代健康全国重点实验室教授、博士生导师。师从北京大学汤富酬教授从事单细胞多组学测序研究，已在Science、Cancer Cell、National Science Review等国际著名期刊发表多篇高水平研究论文。入选中国科协第六届“青年人才托举工程”、江苏省“333”高层次人才培养对象，主持国家自然科学基金面上项目，担任国家重点研发计划项目骨干。担任National Science Review、Journal of Genetics and Genomics和Life Medicine等多个学术期刊青年编委，中国人体健康科技促进会生育力保护与保存专业委员会常委、江苏省整合医学研究会遗传性肿瘤专委会委员等，以及长期担任 Cancer Discovery 、 Nature Communications 、 Genome Biology 等多个期刊的特邀审稿人。课题组建立的生殖及肿瘤数据库平台（ https://smart-db.cn/ 和 https://bianlab.cn/scCancerExplorer ）被来自全球 46 个国家（中国、美国、德国等）超过 3.4 万名科研用户使用，累计完成 179 万余次分析任务。
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课题组研究方向：单细胞多组学大数据分析/生殖生物信息学 U=t'>;(g  
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本课题组干湿结合，已建立单细胞多组学平台，具备齐全的科研设备和优越的实验条件，已与医院和多个课题组建立长期合作关系，导师可给予充分指导，同时也可在课题方向上给予同学们一定的自由探索的空间。课题组成员积极向上，团结互助，关系融洽。 IN"vi|1  
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课题组主页:https://bianlab.cn/ [v`4OQF/  
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基本要求： 2X*<Fma3C  
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1、英语六级通过，并请在简历中注明六级成绩； C6w{"[Wv=X  
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2、认真、严谨，有钻研精神； \2pFFVT  
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3、生命科学相关专业或具有相关科研基础，生物信息学相关专业或具有强烈从事生物信息学研究意向的同学将优先考虑，特别优秀者可以适当放宽； H4NEB1TO>  
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4、符合南京医科大学基本招生要求。 v4_OUA>z,  
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申请材料及联系方式： %K'*P56  
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欢迎有意向者将详细的个人简历以及其他能证明个人能力的资料尽快打包发送至以下邮箱：bianshuhui@njmu.edu.cn，邮件主题请注明“2025博士申请+姓名”。 c4>sE[]  
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代表性论文：(*为并列第一作者，#为通讯作者) s>@#9psm  
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1. Bian, S.*, Hou, Y.*, Zhou, X.*, Li, X.*, Yong, J.*, Wang, Y.*, Wang, W., Yan, J., Hu, B., Guo, H., Wang, J., Gao, S., Mao, Y., Dong, J., Zhu, P., Xiu, D., Yan, L., Wen, L., Qiao, J.#, Tang, F.#, Fu, W.#, 2018. Single-cell multiomics sequencing and analyses of human colorectal cancer. Science 362, 1060–1063. 发表当年影响因子=41.063 1%hM8:)i_  
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2. Zhou, Y.*, Bian, S.*, Zhou, X.*, Cui, Y.*, Wang, W., Wen, L., Guo, L., Fu, W.#, Tang, F.#, 2020. Single-cell multiomics sequencing reveals prevalent genomic alterations in tumor stromal cells of human colorectal cancer. Cancer Cell 38, 818–828.e5. 发表当年影响因子=31.743 7"n1it[RJ8  
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3.  Bian, S.*,, Wang, Y.*, Zhou, Y.*, Wang, W., Guo, L., Wen, L., Fu, W., Zhou, X.#, Tang, F.#, 2023. Integrative single-cell multiomics analyses dissect molecular signatures of intratumoral heterogeneities and differentiation states of human gastric cancer. National Science Review. 发表当年影响因子=20.6 g \qL}:  
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4. Changzhi Huang*, Zekai Liu*, Yunlei Guo*, Wanchu Wang*, Zhen Yuan, Yusheng Guan, Deng Pan, Zhibin Hu, Linhua Sun#, Zan Fu#, Shuhui Bian#, 2024. scCancerExplorer: a comprehensive database for interactively exploring single-cell multi-omics data of human pan-cancer. Nucleic Acids Research, gkae1100. (主要通讯作者) 发表当年影响因子=16.7 jTd4H)  
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5. Liu, Z.*, Yuan, Z.*, Guo, Y.*, Guan, Y., Wang, R., Wang, Z., Chen, Y., Wang, T., Jiang, M., Bian, S.#. SMARTdb: an integrated database for exploring single-cell multi-omics data of reproductive medicine. Genomics, Proteomics & Bioinformatics, qzae005 (2024).  (独立通讯作者)发表当年影响因子=11.5 ?GUz?'d  
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本课题组建立的迄今国际规模最大的生殖医学单细胞多组学数据库网址：https://smart-db.cn/ .#=j <&  
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6. Fan, X.*, Lu, P.*, Wang, H.*, Bian, S.*, Wu, X.*, Zhang, Y., Liu, Y., Fu, D., Wen, L., Hao, J.#, Tang, F.#, 2022. Integrated single-cell multiomics analysis reveals novel candidate markers for prognosis in human pancreatic ductal adenocarcinoma. Cell Discovery 8, 13. 发表当年影响因子=38.090 /<(*/P,>  
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7. Wang, M.*, Liu, X.*, Chang, G.*, Chen, Y.*, An, G.*, Yan, L., Gao, S., Xu, Y., Cui, Y., Dong, J., Chen, Y., Fan, X., Hu, Y., Song, K., Zhu, X., Gao, Y., Yao, Z., Bian, S., Hou, Y., Lu, J., Wang, R., Fan, Y., Lian, Y., Tang, W., Wang, Y., Liu, J., Zhao, L., Wang, L., Liu, Z., Yuan, R., Shi, Y., Hu, B., Ren, X., Tang, F.#, Zhao, X.#, Qiao, J.#, 2018. Single-cell RNA sequencing analysis reveals sequential cell fate transition during human spermatogenesis. Cell Stem Cell 23, 599-614.e4. 发表当年影响因子=21.464 %rpR-}j  
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8. Zhao, J.*, Lu, P.*, Wan, C.*, Huang, Y.*, Cui, M., Yang, X., Hu, Y., Zheng, Y., Dong, J., Wang, M., Zhang, S., Liu, Z., Bian, S., Wang, X., Wang, R., Ren, S., Wang, D., Yao, Z., Chang, G.#, Tang, F.#, Zhao, X.#, 2021. Cell-fate transition and determination analysis of mouse male germ cells throughout development. Nature Communications 12, 6839. 发表当年影响因子=17.694 -yX

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